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在KEGG pathway database 搜尋 LMP1

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挑出11種相似程度不同的 LMP1 proteins:

P03230(100%)、H9C5V4(98%)、H9C5V5(97%)、Q6RKP8(96%)、P13198(95%)、Q7T6U4(94%)、H9C5W7(93%)、Q6PKR4(92%)、H9C5W4(91%)、Q6PKQ6(88%)、A8C6Z9(87%)

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使用SMS 計算LMP1 protein weight ,MW=35.40KD

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使用SMS(Sequence Manipulation Suite)點選ORF finder搜尋 LMP1基因序列的 open reading fram

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LMP1的基因序列

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Epstein-Barr virus(EBV)為Human gamma herpesvirus之一,主要感染人類的表皮細胞和淋巴細胞。

LMP1(Latent membrane protein 1)是EB病毒在感染細胞內所合成的蛋白中,影響到細胞的正常功能,因而使細胞不再受到正常的調控,成為癌細胞,而不斷地增多。

功能:

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課程名稱:生物資訊分析課程
指導老師:鄧致剛
系所:生醫所 生化組 
學號:M0101130
姓名:張家豪


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